泰平を迎えた世で、東間国城主が急死する。忘れ形見の紗代姫は事の察し、 真相を探るため東間国を狙う隣国「浅賀国」への調査を、 代々仕える忍び『霞谷衆の矢代陣馬』に命じるが、直後、 浅賀の放った忍集団『冥極党』の襲撃により霞谷の里は壊滅してしまう…。 生き残った仲間を集め、強大な敵・浅賀と外法妖術を 極めた冥極党を倒すために、陣馬は、静かに暗闘を始めるのだった。

軽工業・重工業・電子産業等、様々な世界でシェアNO．1を誇る企業「SHE（通称：シー）」社で研究室の主任を勤めるほどのプログラマー、井深 雅也（いぶか まさや）。 雅也が学生の頃から連綿と磨き上げてきた人工知能技術が、兵器へと転用されることになってしまい、彼は「SHE」研究所から脱走しようと画策する。 逃亡先の会社は、近年の「SHE」社の悪辣ともいえる専横を阻止するべく暗躍する「ジョナサン・J・マッコイ」率いる「M．C．」社だった。 逃走計画は一応の成功を見せるが、機密の一部を偶然持ち出してしまった雅也は、「SHE」から激しい追跡を受けてしまう。 一方、雅也を「M．C．」に引き込んだ張本人、幼馴染みの樹里（じゅり）は、「SHE」を元の健全な企業に戻すために戦うことを決意していた。 雅也と樹里の利害は一致し、団結して「SHE」と戦うことになり、雅也のパートナー、人工知能のティエラもこれに参戦する。 果たして雅也たちは、「SHE」との戦いに勝利することができるだろうか――。

南海の新大陸 『エリュシオン』。 活性化した魔物が闊歩する地上で最も危険な場所にもかかわらず、豊富な資源を求め、中でも竜の力を制御し無尽蔵のエネルギーを生む秘宝 “竜秘玉（カーバンクル）” に一攫千金の夢を馳せる者たちが多く集っていた。 主人公・ラディウスは、難病の妹の莫大な治療費を稼ぐため、仲間と共に秘宝の在り処を探る冒険者の一人。 「俺は、家族の命を守るために、この剣を振るうだけだ！」 ――しかし、そんな純粋な決意も謀略に巻き込まれようとしていた。 向かう先にあるのは、人としての正義か、それとも闇に蠢く獣の意思か──。