主人公、姫川真（ひめかわまこと）は白羽学園に通っている。ある朝、登校途中に自動販売機の暴走で困っている女の子を見つける。同じ白羽学園の制服を着ているが、見たことのない子だ。助けて上げようとジュースを拾うのを手伝うが、その好意が災いしてその女の子はジュースまみれに。逆に恨みを買う羽目にあってしまう。軽い言い合いのあと、主人公はこの女の子を「トラブル女」と命名。
そんな事がありつつ学校に着き（遅刻）、朝のHR。どうやら今日から転校生がやってくるとの事・・・が。
なんとその転校生とは、朝の「トラブル女」であった。

平素だった学園生活も、転校生・有里の登場で、トラブル続きの「退屈しない」日々に変わり、運動会・学園祭・紅葉狩り、と秋ならではの通例行事を（普通じゃなく）過ごしていく中で、その騒動はどんどん輪を広げ、果てには思いがけない事件に巻き込まれていく。