実の両親を異界からの侵略者ビーストの中でも『魔王』と呼ばれていた存在に殺されてしまった藤井伊織はある日、ひょんな事から女性にしか使えないはずの変身アイテム『マギアドライバー』に適合する。
そして、伊織はマギアドライバーの使い手であるマギア装者となり、幼馴染であり装者の天王寺梨央と共に人間を一時的にビーストに変化させられる正体不明の少女『バビロン』と戦っていく事になる……。