二〇〇〇年、夏。

信州の山奥にある閉鎖的な集落・久坂村では、ひっそりと祭りの準備が進められていた。
それは十九年に一度だけ行われる秘祭、『月待ちの儀』と呼ばれるものである。

儀式を取り仕切るのは、この土地を古くから支配する倉木家。
彼らは『椿館』と呼ばれる花が咲き乱れた壮麗な洋館に住み、
独自のしきたりを守り続ける謎めいた一族だった。

主人公の羽山浩一は、本家である倉木家からの呼び出しを受けて椿館へ向かうことになる。
彼は女性の顔が認識できない奇病を持つ上、連日の悪夢に悩まされており、その日も幻覚に襲われて担ぎ込まれるように到着した。

しかし倉木家で悪夢から目覚めた彼は、突然女性の顔をはっきりと見えるようになる。
相手は倉木鈴菜。この家の一人娘であり、『月待ちの巫女』だった。

やがて浩一は倉木家の当主になり、一ヶ月後の『月待ちの儀』までこの館に滞在するように言いつけられるが──。