舞台は海と山に囲まれた都市・冬木市。 何の変哲もないこの街に、少しずつ侵食する闇があった。 手にした者の願いを叶えるという聖杯。 その聖杯を実現させる為、一つの儀式が行われようとしていた。 聖杯に選ばれた七人の魔術師（マスター）に、聖杯が選んだ七騎の使い魔（サーヴァント）を与える。 騎士 "セイバー" 槍兵 "ランサー" 弓兵 "アーチャー" 騎兵 "ライダー" 魔術師 "キャスター" 暗殺者 "アサシン" 狂戦士 "バーサーカー" マスターはこの七つの役割（クラス）を被った使い魔一人と契約し、自らが聖杯に相応しい事を証明しなければならない。 つまり。 マスターとなった者は他のマスターを消去して、自身こそ最強だと示さなければならないのだ。 杯を求める行いは、その全てが“聖杯戦争”と呼ばれる。 この地に起きる儀式は、その名に恥じない“殺し合い”といえるだろう。 幼い頃火災によって両親を失い、孤児になった主人公は魔術師を名乗る人物に引き取られる。 養父の反対をおしきって魔術を習う主人公だが、まったく才能がなく何年とかけて身についた魔術は一つだけだった。 その養父も今は亡く、主人公は半人前の魔術師として成長する。 そうして現在。 ふとしたきっかけからマスター同士の戦いに巻き込まれた主人公は、偶発的に七人のサーヴァントの一人、セイバーと契約する事になる。 望まぬままマスターの一人になった主人公は、聖杯を巡る戦いに身を投じる事になるのだが────

―――在那坡道尽头的古宅之中，有两位魔女闲居于此――― 时值1980年代后期，这个繁华又充满活力的时代正值黄昏。 来到城市的少年，与生活在现代社会的两位魔女萍水相逢。 少年的日常起居与一般人别无二致， 而她总是昂首挺胸盛气凛然， 少女则是仿佛熟睡一般隐居于此。 形色各异的三人相逢于此， 他们的命运就此开始交织。 截然不同的三人，他们共同生活的故事即将开幕——― ―――坂の上のお屋敷には、二人の魔女が住んでいる――― 1980年後半。華やかさと活力に満ちた時代の黄昏時。 都会に下りてきた少年は、現代に生きる二人の魔女とすれ違う。 少年はごく自然に暮らしてきて、 彼女は凛々しく胸を張って、 少女は眠るように隠れ住んで。 三者三様の星の巡り。 交わることなんてもってのほか。 何もかも違う三人の共同生活が始まるのは、あと、もうちょっと先の話―――