※注：Steam版剧情参考PS Vita/Switch版《吉原彼岸花 久远之契》内容进行了全年龄向变更，不含PS Vita/Switch版追加内容辰吉线。

时值江户时代。
绚烂豪华的城镇背后，盘踞着欲望重重的新吉原。
千早是老字号游廓【樱华屋】内最高位的花魁。
为了回到故乡双亲的身旁，她不分昼夜地与不知姓甚名谁的男性同床共枕。
每日一成不变。
吉原内这个小小的世界对千早而言却是证明自己价值的重要场所。
楼主时雨、她的秃——柚子，还有与她共事的其他可靠的游女们……
有这些对她来说不可替代的人们陪在身边，即便这里被称作苦界，千早也依然为自己花魁的工作自豪。
直到她知晓真正的爱是什么——

年轻的驳船商主人，伊势屋惣一郎。
年少的绾发师，朔夜。
好玩乐的轻薄武士，大月忍。
无情的利贷商，神乐屋彰人。
樱华屋的楼主，樱华屋时雨。

这是在五位男性各自不同的思绪之中，一位游女逐渐被无法抗拒的命运吞噬时，她所经历的跌宕起伏的故事。