1975年的『IBN5100制成』1991年的『海湾战争』2000年的『千年虫问题』2009年的『新世代的疯狂事件、涉谷毁灭』 2010年的『某个划时代的发明』 下一个世界线的大分歧是在2019年的种子岛。 舞台是中央种子岛高中即将被废部的机器人研究部。 Robotic;Notes的故事发生在世界线变动率『1.048596』的世界线上。 也就是处在Steins；Gate世界线延长线上2019年的种子岛。 这时手握关键的是『JAXA』。 “拯救世界的不是英雄——而是死宅。”

高中私立翠明学园二年级学生的西条拓巳，自称对三次元没有兴趣，和家里的大量美少女人偶一起生活。在他所住的涩谷在2008年9月7日以来发生了连续猎奇杀人事件“新世代的疯狂（ニュージェネレーションの狂気）”，成为了网络和电视上的热门话题。 2008年9月28日深夜，拓巳在聊天室遇到了一个自称“将军”的人。“将军”发言中的URL链接到像是预言下一个猎奇事件的恐怖图像。 第二天，拓巳遇到了和图像中的手法一样的杀人现场。在尸体前站着浑身是血的少女，咲畑梨深。

2009年11月6日。 渋谷区でM7.8の局地的な地震が発生。 渋谷駅周辺の市街地は壊滅状態となり、最終的な死者は3851人に達した。 そして、2015年。 物語は復興後の渋谷から始まる——

亵渎神灵的第12项理论 ————那是我们所得到的偶然产物 冈部伦太郎——通称冈伦——是个尚未从厨二病毕业的大学生。 自称为「狂气的疯狂科学家·鳳凰院凶真」，与其他两名成员组成立了名为「未来道具研究所」的社团，每天和朋友们发明着稀奇古怪的东西。 这样的他在一次偶然间发明了能将电子短信传到过去的道具， 也就是说产生了“时间机器”—— SERN、John Titor、幻之古董PC“IBN5100”、时间机器、 蝴蝶效应、时间旅行的11种理论——在这诸多要素偶然重叠之时，秋叶原卷起了世界规模的大事件！ 被委以“未来选择权”的冈伦他们下的决断是？

―これは、救えなかった「未来」の物語。 ２０１０年１１月 β世界線― 主人公・岡部倫太郎が数々の苦難、悲哀を乗り越えた果てに 「彼女」を救うことをあきらめてしまった世界線。 失意の底にある岡部倫太郎。 彼を心配する仲間たち。 救われなかった「彼女」はどうなったのか？ 新たなキャラクターを迎えて描かれる「ゼロ」の物語。 そう、そこに『彼女』は今もいるー

故事舞台为2037年的东京・中野。主角高冈步论与好友弓川十字搭档从事着黑客工作，在这片自2036年2月6日的世界级巨大灾害“哀伤之晨”中幸存之地生活。 在这样的日子里，某天出于一些琐碎细故，步论脱口跟大家宣告说他约好了要与人“私奔”，但其实根本只是信口胡说。没想到，原本预期不会有人出现的步论，却在会合地点邂逅了一位神秘少女“桃”。 随后，神秘的袭击者紧追着桃现身。 正当步论与桃上演着绝地大逃亡之际，他取得了一个神秘的应用程式“存档＆读档”，获得能像电玩游戏那样将特定时刻存档重新来过的能力，两人也因此逃出了生天。然而，这一切却只不过是连串事件的开端…… 神秘的天才黑客“Cicada3301”与其抛出的各式无解“任务”； “垓机关”唤醒了本已冻结的地球模拟器； 以及私下谋划策动的梵蒂冈“513圣务室”派出的刺客阵。 在与桃的邂逅之后，步论被卷入了各方错纵的阴谋与企图之中，挺身而出面对撼动整个世界的大事件。 发挥黑客之力与“存档＆读档”等一切之后，方能在彼端看见的真相是？ “黑进”无限分歧的现实世界，“读档”找出拯救世界的结局吧！ 这是一段改写未来的“黑客”们的故事。